湿原と接する台地の縁辺部からは、豊富な湧水の湧出を観測することができます。　この湧水は湧出量が年間を通して安定しており、広大な集水域から流れ込む河川水と並び釧路湿原を涵養する重要な水源となっています。　湿原域東側では、湧出点の密度が高くなっていますが、これは湿原西側と比較して谷の形状が細長いために湧出点である台地の縁辺部の総延長がより長くなっているためです。また、河川水と比較して貧栄養であることが水質的な特徴として挙げられます。