湿原域内には草本の湿原植生のほか広葉樹林の分布が見られますが、この大部分は湿原性のハンノキです。これらはその大部分が湿原西部に分布していますが、東部の湿原縁辺部（湿原触手の先端部）にも分布がみられます。

湿原域外で河川沿いの湿原域と接している低地には農地・ササ地および草地が広がっています。

湿原域周囲の台地上は主に落葉広葉樹によって構成されていますが、シラルトロ沼の上流域には針葉樹植林地も分布しています。また、湿原域東側の台地上には農地の分布がみられ、特に塘路湖の上流域に集中しています。

釧路川流域の上流部の山地にはカラマツの植林地が分布しており、さらに標高の高い流域界付近には針葉樹林・針広混交林が広がっています。